Kısmi gölgelenme, güneş enerjisi pompa sistemleri için son derece zararlıdır. Tetiklediği "sıcak nokta etkisi" ve "varil etkisi" nedeniyle, en ufak bir engel bile sistemin güç çıkışının %50'den fazla düşmesine, su çıkışında ani bir düşüşe, ekipmanların sık sık çalıştırılıp durdurulmasına ve hatta tamamen kapanmasına neden olabilir.